Eine Schlüsselanwendung der synthetischen Biologie ist die Entwicklung neuer Stoffwechselwege in mikrobiellen Expressionssystemen zur Herstellung innovativer Produkte wie Biokraftstoffe und neue chemische Bausteine. Diese modernen Bioprozesse nutzen erneuerbare Rohstoffe als Substrate und schaffen eine neue nachhaltige Industrie, die als Bioökonomie bezeichnet wird.

Die BioLector-Technologie kann in diesem Bereich eingesetzt werden, um das physiologische Verhalten von synthetischen Wanzen zu untersuchen. Durch Veränderung der Stoffwechselwege können auch das Wachstumsverhalten und die Versauerung des Mikroorganismus beeinflusst werden, was vor der Entwicklung eines neuen Bioprozesses eingehend untersucht werden muss. Die Mikrobioreaktortechnologie verarbeitet all diese neuen Wanzen unter verschiedenen Kultivierungs- oder Medienbedingungen im Hochdurchsatzverfahren, wobei die Prozessparameter online überwacht werden.

Die erzeugten Produzenten können leicht durch spezifische Wachstumsraten, Ansäuerungsraten, Sauerstoffverbrauch oder durch Produktbildungsraten charakterisiert und verglichen werden. Durch die Verwendung von fluoreszierenden Proteinen (z.B. GFP) als Reporter wird der BioLector XT Mikrobioreaktor außerdem häufig zur grundlegenden Charakterisierung neuer Promotoren oder sogar ganzer Bibliotheken synthetischer Promotoren eingesetzt.